Sa première série, Griffin Dark (scénario Crisse), parait en 1997 aux éditions Vents d’Ouest sous le pseudonyme de Stanley. Il publie ensuite, en 2001, le premier tome de la série Les Échaudeurs des Ténèbres aux éditions Soleil.
On le retrouve en 2004, avec le premier tome de Belladone (Soleil), une série de cape et d’épée scénarisée par Ange, dont le troisième et dernier tome parait en 2007.
Suivront 3 tomes de Sinbad avec Arleston, puis l’adaptation de Moby Dick avec Olivier Jouvray. En 2013, commence la série Silas Corey scénarisée par Fabien Nury. Cette dernière, publiée chez Glénat, comprend quatre tomes à ce jour.
De 2006 à 2018, Pierre Alary participe également à plusieurs one-shots collectifs, tels que Parole de Poilus (Soleil), Polnareff (Soleil), Spider-Man Family (Marvel Comics) et plus récemment Conan Le Cimmérien (Glénat).
En 2018, il publie son premier one-shot chez Rue de Sèvres, le très remarqué Mon traître, adapté du roman éponyme de Sorj Chalandon. Il enchaine en 2019 avec l’adaptation du pendant de l’histoire, Retour à Killybegs.
Pierre Alary arrivera chez Dargaud au second semestre 2020, avec son album Don Vega.