Après ses études Milan travaille pendant plus de deux ans dans un studio d’animation. Parallèlement, il collabore comme illustrateur et designer dans différentes agences de pub et revues.
La rencontre avec le scénariste Dorde Milosavljevic sera le point de départ de leur collaboration sur la série historique « Kalokagathia » (deux albums parus). Milan Jovanovic sera d’ailleurs récompensé pour à cette série par le « Prix du meilleur jeune auteur » au Salon de BD de Zajecar en 1996.
Une longue amitié avec Darko Macan, un scénariste Croate de renommée internationale, aboutit à une série en cinq volumes « La Bête Noire » publié par Novi Sad.
En 2001 il participe à la création et à la rédaction du magazine de bande dessinée « Bager » et sera notamment membre du comité éditorial.