Dès 1983, il participe à la revue « Viper » et réalise parallèlement son premier album chez Glénat, « l’Enfer du jour », qu’il redessinera en 1995 sous forme de BD-roman aux éditions Dargaud. Il collabore également régulièrement au magazine « Circus Hors-série », et dessine pour Vécu la série « Yérushalaim ».

S’ensuivent quatre années de travaux alimentaires divers, seulement interrompus par la sortie en 89 de « La Pension des Deux Roses », aux éditions Magic Strip. Durant cette période de transition, Emmanuel Moynot se consacre à sa passion initiale, la musique. Auteur-compositeur, chanteur, guitariste, et harmoniciste, il trouve dans la musique une forme d’expression complémentaire à la bande dessinée.

En 1992, parait le premier tome du « Temps des bombes ». Sa collaboration avec Dieter commence dès le troisième tome de la série, et se poursuit encore actuellement, sur la série « Vieux Fou ».

Toujours avec Dieter, « Qu’elle crève la charogne ! » en 1995 chez Vent d’Ouest, puis deux tomes de « Nord-Sud », « Moscou » et « Los Angeles », tous deux chez Dargaud. En 1995, il redessine et augmente « L’enfer du jour » pour une version BD roman en noir et blanc chez Dargaud. « A quoi tu penses ? »parait en 2000 chez Casterman. Il fait suite à « Bonne fête Maman ! » et « Pendant que tu dors, mon amour » réalisés tous deux avec Dieter.

En 2006, parait « Pourquoi les baleines bleues viennent-elles s’échouer sur nos rivages » dans la collection Aire Libre des Editions Dupuis. Il s’agit là d’un grand roman noir, par un Emmanuel Moynot au sommet de son art !